Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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