Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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