Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PABPC3-201ENST00000281589 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR51D1-202ENST00000641817 3561 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 TEX46-203ENST00000622840 479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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