Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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