Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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