Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NMBRP28336 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms