Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2599.8 ms