Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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