Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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EHD3Q9NZN3 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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