Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GDAP2Q9NXN4 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GDAP2Q9NXN4 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms