Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLFN5-203ENST00000592325 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms