Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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