Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms