Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms