Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL40Q2TBA0 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms