Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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