Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms