Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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VPS72Q15906 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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VPS72Q15906 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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