Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CYTH1Q15438 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms