Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms