Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC00678-201ENST00000527083 786 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 ZNF585B-207ENST00000586320 403 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RN7SL434P-201ENST00000495872 271 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC010719.1-201ENST00000602992 747 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NBR1Q14596 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NBR1Q14596 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
NBR1Q14596 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
NBR1Q14596 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NBR1Q14596 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NBR1Q14596 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NBR1Q14596 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms