Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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