Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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HTR4Q13639 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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HTR4Q13639 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HTR4Q13639 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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HTR4Q13639 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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HTR4Q13639 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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HTR4Q13639 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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HTR4Q13639 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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HTR4Q13639 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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HTR4Q13639 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HTR4Q13639 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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