Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms