Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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