Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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