Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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