Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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