Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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