Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms