Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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PTPRMP28827 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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PTPRMP28827 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTPRMP28827 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTPRMP28827 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTPRMP28827 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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