Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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