Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPREP23469 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPREP23469 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
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