Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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