Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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