Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms