Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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RNF17Q9BXT8 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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RNF17Q9BXT8 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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