Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms