Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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DTX3Q8N9I9 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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DTX3Q8N9I9 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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DTX3Q8N9I9 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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DTX3Q8N9I9 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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DTX3Q8N9I9 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DTX3Q8N9I9 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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