Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms