Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms