Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PCM1Q15154 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms