Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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