Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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