Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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