Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms