Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTPRCP08575 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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PTPRCP08575 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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