Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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