Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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