Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms